Die Turbulenzen dieser Zeit mit ihrer starken antireligiösen Strömung störten die Ruhe dieses verehrten Ortes.

Durch ein Gesetz vom November 1789 wurde das gesamte Eigentum des Klerus und damit der Kirche verstaatlicht und zum Staatseigentum erklärt.
Aufgrund dieser Bestimmungen wurden zahlreiche Kapellen versteigert und verschwanden dadurch für immer.

Was Bellefontaine betrifft, so zielten die revolutionären Autoritäten in erster Linie auf die kleine Glocke der Kapelle ab, die 57 Pfund wog und gemäß einem Befehl vom 6. August 1791 vom Glockenturm entfernt wurde.
Anschließend wurde es mit einem Pferdewagen nach Aspach-le-Bas transportiert, einem Zentrum für das Sammeln von Metallgegenständen dieser Art, und von dort zur Münze in Straßburg gebracht.

Während die Menschen weiterhin besorgt über das Schicksal der Kapelle selbst nachdachten, richtete die Gemeinde Bréchaumont am 1. Februar 1792 eine Anfrage an das Direktorium des Bezirks Belfort, um den Erhalt dieses Heiligtums zu gewährleisten.

In diesem Memorandum wurde insbesondere argumentiert, dass dieses Gebäude das Werk der Vorfahren des Dorfes sei, als Zeugnis der Verehrung der Jungfrau Maria, und dass es als solches als Gemeingut anzusehen sei und keine andere Behörde darüber verfügen dürfe.
Alles war vergebens, denn am 27. Februar 1792 wurde dieser Antrag, der die Unterschriften von Bürgermeister Bihl, Johanès Blind und Joseph Jung trug, von einem unnachgiebigen Direktorium zurückgewiesen.
Dieses kleine religiöse Gebäude, das als nationales Eigentum anerkannt war, wurde verkauft. Von da an und in den folgenden Jahrzehnten wechselte die Kapelle mehrmals den Besitzer.

Im Jahr 1795, als die Behörden diese Pilgerfahrt endgültig für beendet erklärten, kamen immer noch viele Gläubige, sogar in Gruppen, um den Ort zu besuchen und dort zu beten, was einigen „Patrioten“ (im Sinne von extremen Anhängern der Revolution) von Bréchaumont sehr missfiel.
Nach Beschwerden und Forderungen der Betroffenen wurde ein gewisser Herr (oder besser gesagt Bürger) Hartmann aus Fontaine zum Kommissar ernannt, der mit der Untersuchung dieser Angelegenheit beauftragt war.